Animaux des cours d'eau

Les cours d’eau désignent les chenaux naturels d’eau douce en écoulement, organisés autour d’un lit et de berges, où l’eau circule sous l’effet de la gravité de l’amont vers l’aval. Dans notre système d’habitats, ils se distinguent des plans d’eau stagnants par leur dynamique longitudinale (courant), leur transport continu de sédiments et de matières organiques, et la variabilité spatiale des habitats (radiers, mouilles, bras secondaires) créée par la pente, le débit et la nature du substrat. La qualité écologique y dépend fortement du régime hydrologique, de la connectivité avec les sources, zones humides et plaines alluviales, ainsi que de l’alternance entre phases d’étiage et de crue.
Ces milieux se caractérisent par un gradient amont-aval marqué : eaux souvent plus fraîches, rapides et oxygénées en tête de bassin, puis écoulement plus lent, plus chaud et plus chargé en fines en aval. Les berges et ripisylves contribuent à l’ombrage, à la stabilisation des rives et aux apports de bois mort, créant des refuges et une hétérogénéité hydraulique. Inclus les écoulements lotiques naturels, qu’ils soient continus ou intermittents, avec leurs éléments fonctionnels associés (lit mineur, bancs de graviers, seuils naturels, bras et annexes temporairement connectés), dès lors que la dynamique est celle d’un cours d’eau.